郭宵飞,李智飘,李静静,张平

• 1:中国中医科学院望京医院
• 2:北京中医药大学

摘要(Abstract)：

目的 探索中药干预DNA高甲基化的物质基础及用药规律。方法 首先，整合GeneCards、OMIM、GenCLip 3等数据库，从中获取可作用于DNA高甲基化的相关靶点，然后利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选出类药性≥0.18的靶点，并收集其相关化合物及中药，构建靶点-化合物、靶点-化合物-中药网络，分析靶点、化合物、中药之间的相关性。另外，匹配中药的性味归经等信息，分析用药规律。最后，将网络中核心靶点与化合物进行分子对接，以验证预测结果及进一步挖掘潜在的化合物靶点组合。结果 共得到189个可作用于DNA高甲基化的靶点，其中有35个靶点可匹配到候选化合物且类药性≥0.18，匹配到1 188个候选化合物，共408味中药。频数统计结果显示，干预DNA高甲基化的中药药味以苦、辛、甘为主，药性以温居多，主要归肝、肺二经。结论 本研究通过系统探讨中药干预DNA高甲基化的物质基础及用药规律，可为中药去甲基化的理论研究及临床应用提供新思路。

关键词(KeyWords)： DNA;高甲基化;中药;网络药理学;用药规律;新药研发

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 中国中医科学院科技创新工程（CI2021A05054）;中国中医科学院科技创新工程（CI2021A01818）;; 国家自然科学基金项目（82174415）;; 中国中医科学院望京医院院级科研项目（WJYY2020-19）

作者(Author): 郭宵飞,李智飘,李静静,张平

参考文献(References)：

• [1] Moore LD,Le T,Fan G. DNA methylation and its basic function[J]. Neuropsychopharmacology,2013,38(1):23-38.
• [2] Issa JP. DNA methylation as a therapeutic target in cancer[J]. Clin Cancer Res,2007,13(6):1634-1637.
• [3]钱芳，张刚. DNA甲基化与肿瘤的相关研究进展[J].医学综述，2013,19(3):445-448.
• [4] Klutstein M,Nejman D,Greenfield R,et al. DNA methylation in cancer and aging[J]. Cancer Res,2016,76(12):3446-3450.
• [5] Kulis M,Esteller M. DNA methylation and cancer[J]. Adv Genet,2010(70):27-56.
• [6] Kumar U,Sharma U,Rathi G. Reversal of hypermethylation and reactivation of glutathione S-transferase pi 1 gene by curcumin in breast cancer cell line[J]. Tumor Biology,2017,39(2):1010428317692258.
• [7] Marilyn S,Irina D,Justin A,et al. GeneCards version 3:the human gene integrator[J]. Database,2010(2010):baq020.
• [8] Amberger JS,Bocchini CA,Francois S,et al. OMIM.org:online mendelian inheritance in Man OMIM,an online catalog of human genes and genetic disorders[J]. Nucleic Acids Research,2015,43(D1):D789-D798.
• [9] JH Wang. Gen CLiP 3:mining human genes′functions and regulatory networks from PubMed based on co-occurrences and natural language processing[J]. Bioinformatics,2020,36(6):1973-1975.
• [10] Consortium T. UniProt:the universal protein knowledgebase[J]. Nucleic Acids Research,2018,46(5):2699.
• [11] Ru J,Li P,Wang J,et al. TCMSP:a database of systems pharmacology for drug discovery from herbal medicines[J]. Journal of Cheminformatics,2014,6(1):1-6.
• [12]国家药典委员会.中华人民共和国药典：一部[M].北京：中国医药科技出版社，2020.
• [13]唐德才.中药学[M]. 3版.北京：人民卫生出版社，2016.
• [14] Issa JP. DNA methylation as a therapeutic target in cancer[J].Clin Cancer Res,2007,13(6):1634-1637.
• [15] Russo GL,Ungaro P. Epigenetic mechanisms of quercetin and other flavonoids in cancer therapy and prevention[M]//Epigenetics of cancer prevention[J]. Academic Press,2019:187-202.
• [16] Tan S,Wang C,Lu C,et al. Quercetin is able to demethylate the p16INK4agene promoter[J]. Chemotherapy,2020,55(1):6e10.
• [17] Crocetto F,di Zazzo E. Kaempferol,myricetin and fisetin in prostate and bladder cancer:A systematic review of the literature[J]. Nutrients,2021,13(11):3750.
• [18] Qiu W,Lin J,Zhu Y,et al. Kaempferol modulates DNA methylation and downregulates DNMT3B in bladder cancer[J].Cell Physiol Biochemn,2017,41(4):1325-1335.
• [19] Mukherjee N,Kumar AP,Ghosh R. DNA methylation and flavonoids in genitourinary cancers[J]. Curr Pharmacol Rep,2015(1):112-120.
• [20]章明，周莹，吴超，等.女贞子对HepG2肝癌细胞相关基因去甲基化作用的研究[J].江西中医药，2017,48(5):61-64.